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巴西SARS-CoV-2再感染病例E484K突波突变的基因组证据

Carolina Kymie Vasques Nonaka,Marilia米兰达佛朗哥,蒂亚戈伯爵,安娜·维丽娜·阿尔梅达·门德斯,雷纳托·桑塔纳·德·阿吉亚尔,玛尔塔Giovanetti *,布鲁诺·索拉诺·德·弗雷塔斯·索萨
版本1收稿日期:2021年1月5日/批准日期:2021年1月6日/出版日期:2021年1月6日(CET 20:38:36)
版本2:收到日期:2021年1月26日/批准日期:2021年1月27日/出版日期:2021年1月27日(CET 15:08:12)

如何引用:Vasques野中郁次郎,C.K.);米兰达佛朗哥,m;伯爵、t;阿尔梅达门德斯前任所长A.V.;Santana de Aguiar, R.;Giovanetti m;巴西SARS-CoV-2再感染病例E484K突变的基因组证据。预印本2021, 2021010132Vasques野中郁次郎,C.K.);米兰达佛朗哥,m;伯爵、t;阿尔梅达门德斯前任所长A.V.;Santana de Aguiar, R.;Giovanetti m;巴西SARS-CoV-2再感染病例E484K突变的基因组证据。预印本2021,2021010132

摘要

到目前为止，对SARS-CoV-2的保护性免疫反应持续多久仍不确定，并且在首次发作几个月后，康复患者中开始出现疑似再感染的报告。病毒进化可能有利于再感染，最近在英国、南非和最近在巴西流行的SARS-CoV-2谱系中发现的突突突变，特别是受体结合域(RBD)突变，引起了人们对其在传染性、免疫逃逸和再感染方面的潜在影响的关注。我们报告了一例来自不同SARS-CoV-2谱系的再次感染病例，在巴西出现E484K突变，这种突变与逃避中和抗体有关。

主题领域

SARS-CoV-2;再感染;E484K

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评论(1)

评论1
收到:2021年1月27日
评论:玛尔塔Giovanetti
评论者的利益冲突:作者
备注:两个新全基因组序列与巴西同时期序列的系统发育分析(补充表1)，明确表明间隔147天的两次COVID-19病例确实是由不同的SARS-CoV-2血统引起的，证实了再次感染(图1 b)。在第一集中，检测到血统B.1.1.33，而在第二次感染中检测到血统P.2 (B.1.1.28.2的别名)(图1 面板B)，根据穿山甲谱系分类(pangoLEARN版本2021-01-11)。此外，我们还发现了几个区别这两个基因组的突变(图1 c)，其中三种存在于SARS-CoV-2刺突糖蛋白中。在第一次感染中，得到的基因组呈现S:G1219C，在第二次感染中，观察到S:E484K和S:V1176F。
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